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在病房外拦“妖怪”的人

发布日期:2021-10-21 07:00    点击次数:74

人类为什么仰望星空空?

罗帅的回答是:“为了让身边的人过得更好。”

这个微观的故事是关于一群从事基因检测的人。他们希望在基因检测的帮助下,能够为人们预测患病风险,提供健康管理建议,在这个“怪物”进入病房之前将其制止。

以下是关于他们的真实故事:

文|赵冉

编辑|李子。

病房里的“怪物”。

患者的每一口气都在煎熬,非小细胞肺癌带来的巨大痛苦无时无刻不在折磨着他。

在基因检测实验室,罗帅的眼睛正对着患者的肺穿刺样本。

大部分样品已经借助高通量测序仪进行了测试和分析,但只需要最后一个环节。基因检测报告可以和血液检测结果一起为治疗方案提供用药指导!

实验突然中断,罗帅接到医院通知,实验暂停。

北京的夏天又热又沉闷,白大褂下,一股凉意从脚底升起——这意味着病人已经去世了。

他做过几千个活检样本的基因分析,这是最讨厌的一个。

非小细胞肺癌就像一个“怪物”,80%的肺癌都是它的影子。其中,近70%的患者被发现处于中晚期,这种“怪物”的主要致病因素是吸烟。

“真可惜,我救不了它。如果我能提前预防就好了。”

罗帅再也不想抓病房里的怪物了。他想在怪物进入病房之前阻止它们。

几千万年前的秘密。

2019年初春,天冷的时候,罗帅走进北京二环建国门外的一间共享办公室空房间,坐在李智面前。

李智的最后一个身份是一家年薪几百万的私募基金的副总裁。在进入投行之前,他的人生轨迹更多的与生命科学研究有关。

2005年,当李智本科进入武汉大学生命科学学院时,中国的基因检测行业才刚刚起步。

当时,全球多个国家耗资30亿美元的人类基因组测序工作终于完成了——1700万年前,人类从长臂猿的祖先中分离出来,从远古时代就被镌刻进基因双螺旋中60亿个碱基的秘密,第一次在人们惊异的注视下慢慢展开。

当时社会上已经流行“21世纪是生命科学的时代”的说法,但李智所研究的生命科学的专业待遇与他的名气并不成正比。

“国内生命科学医生每个月只拿到1000元左右的工资”,李智认为,从本质上来说,生命科学的产业化程度较低。

2014年,当李志尚还在投资银行的时候,基因检测行业的转折点已经悄然到来。基因检测公司Illumina发布了全新的基因测序仪HiSep x Ten,可以精确测量全基因组序列,将基因测序成本降低到1000美元的水平,基因检测市场开始全面爆发。

随着成本的降低和技术的普及,基因检测的概念逐渐普及。

一个众所周知的例子是,好莱坞女演员安吉丽娜·朱莉在38岁时发现自己携带了一种高危乳腺癌基因突变,于是她接受了双侧乳房切除术。

Illumina采用的基因测序方法是“鸟枪法测序”,有点像拼图游戏。基于完整的人类基因图谱的封面,首先将所有的基因组打乱并切割成随机片段,然后确定每个小片段的序列。最后,像控制拼图封面一样,切片被重新排序以确定它们在基因组中的正确位置。

听起来简单,但实际的测序困难程度好比从一座堆满了拼图碎片的大山里,准确无误地拼一幅图出来。

李智清楚地知道,基因的解读不仅需要生命科学的创新,而且对云计算有着天然的需求:在云计算出现之前,基因数据的分析需要几个月的计算周期,而云计算大大加速了基因数据的分析;基因检测首先拆分小片段,然后对结果进行分段,最后合并结果,就像大数据中的并行计算一样。

“基因测序探索了从生命开始到现在的密码。云计算是一个思想者,把探索者发现的每一条线索都变成了对未来生命进化的预测。”李智说。

他敏锐地意识到基因检测技术的进步和成本的降低,想让普通消费者享受这项技术带来的好处,于是辞职创办了北京拉索生物科技有限公司(以下简称拉索)。

基因检测有两个方向。一个是医学级基因检测,比如罗帅之前的工作,包括生殖健康、肿瘤诊疗等。,而且价格是几万;另一种是消费者级基因检测,为一般消费者提供药物反应检测、遗传病风险检测、健康风险评估、用药风险预警等。在普通医学领域,又给出了健康管理建议,而且价格从几十元到几百元都比较贴近百姓。

李智选择了后者,从西装革履的投行精英,到在知乎上熟练回答基因检测相关问题的企业家;罗帅以“提前告知人们患病风险,通过改变生活习惯降低患病概率”的理念成为拉索的基因顾问。

图|基因检测结果显示,该用户患食管癌的概率较高。

它们现在会飞到更简陋的房子里筑巢和交配

拉索成立时获得天使投资3600万元,这是全球消费者基因检测行业历史上最大的天使投资。

第一个问题摆在李智面前:一个用户的基因数据,即使经过压缩,也接近几百MB。这些数据会被存储和计算,并且会随着遗传学的发展而越来越多,这就需要一个极其聪明的“大脑”。

而“成本”是创业公司的生命线。如何建立可靠、稳定、性价比高的技术支持体系?

云是成本最低的解决方案。“考虑到稳定性、声誉和技术支持能力,我们在阿里巴巴云成立之初就选择了它,”Lasso的CTO何表示。

他是技术行业的老手。他曾经在飞信和360工作,一路看着云计算、SaaS和移动互联网从萌芽到澎湃。

他知道,与其他行业不同,基因检测与生命科学紧密结合,其结构层次各有特点。算法也更专业;用户数据安全是要严加防范的红线。

随着云计算技术的发展,公共云平台已经能够为基因检测公司提供大规模、可扩展的数据计算和分析能力。

拉索基因检测实验室的遗传数据计算移交给云服务器(ECS)。这种灵活且可扩展的计算服务有助于Lasso降低IT成本,提高运维效率,让Lasso更加专注于核心业务创新。面向消费者的核心产品基因宝App的服务器和数据库存储也部署在云上,采用云数据库RDS。

基础已经巩固,服务器和数据库正在等待第一个“访客”。

拉索公司产品科学副总裁唐祖龙清楚地记得,2018年10月21日凌晨4点,基因宝App第一版上线。很快,第一个用户的口水盒到了!

在拉索的广州实验室,从唾液中提取第一个使用者的口腔粘膜细胞,在云上轻而快地检测、计算和分析双螺旋上携带的基因数据,然后翻译成普通现代人都能理解的祖先分析、遗传性状、遗传病突变筛查、用药风险预警等信息。

图| Lasso工作人员用液体质谱仪测试oligo。

罗帅认为,正如“世界上没有两片完全相同的叶子”,同一种药物在不同个体中的药代动力学和药效学特征是不同的。

一片阿司匹林,有些人使用哮喘后会比普通人有更多的副作用,基因检测的结果可以帮助患者自行调整剂量或选择备用药物。

图|基因检测结果提供用药指导。

罗帅记得最“离奇”的一次,一位用户举报父亲是A型血,母亲是O型血,但他的基因检测结果却是AB型。身边的人都劝他“做个亲子鉴定”。

用户很不解,后来通过罗帅了解到,他其实是一种非常罕见的孟买血型,国内只报道了30例左右。

这意味着一般血库是没有这样的血液储备的,所以如果用户需要输血,就要提前做好采血准备。

截至目前,Lasso已为数十万用户提供用药指导信息、遗传病筛查、祖源分析等服务。

除了改变人们的生活,基因检测技术还为宠物提供服务。

虽然许多宠物看起来很健康,但它们可能携带致病基因。宠物遗传病检测可以从宠物口腔内壁分泌物中提取宠物细胞和DNA,分析宠物的遗传信息,提供个性化的育儿、养殖建议和医疗健康指南。

他成雄算了一笔账,在同样规模下,使用云节省了50%的人力成本和30%的服务器成本。

对于初创企业来说,节省下来的每一笔成本都可以支持更多的服务扩展——例如,自建临床诊断水平的实验室,快速的试错,或者为罗帅这样的生命科学从业者提供更好的治疗。

一个人的“战场”

创业公司保持了较快的发展速度,基因宝App一个月迭代两次。越来越多的用户愿意为基因检测付费,越来越多的服务器需要被Lasso租用。

图|拉索工人在通风柜内进行荧光杂交实验。

业务突破的转折点发生在2020年。

拉索生物与高校科研机构合作开发高密度微阵列,涵盖测序仪、芯片、试剂和软件的一体化解决方案,打破了Illumina和Affymetrix在该领域长达20年的垄断。这是中国企业首次在该领域实现国产替代,预计2021年上半年实现量产。

基因检测芯片的成功开发使基因检测的成本降低到原来的一半以下。可以预见,这将进一步降低基因检测的价格,带来用户数量的增加。拉索预测,2021年用户数量将从几十万增加到一百万。

为了承接用户大潮,贺提前调整了技术架构。Lasso最初搭建的系统架构跟不上业务需求,于是购买了一批新的服务器,逐渐将原来的架构改为灵活性更好的Kubernetes集群。

何成雄说:“从长远来看,当用户数量突然爆发时,我们也可以动态租用更多的云计算资源,只需要很少的人工干预。

拉索有20多名开发技术人员,但所有的技术后台操作和维护工作都落在了林露这个出生于上世纪90年代的女孩身上。

林露工作的最后一家公司使用物理机器存储数据。她最怕听到的四个字是“硬盘坏了”。

“在使用物理机存储数据时,应该准备更多的服务器,以确保高可用性和高成本。如果坏了,里面的数据可能会丢失。”如果出现大故障,会有几个运维人员整天围着修。

在Lasso,Lulin魏云的技术平台都上云了,“稳定性有保障,很多运维成本降低”,但也意味着“有很多技术需要学习”。

幸运的是,她背后有一个“虚拟团队”。工单是她最重要的“帮手”之一。在Lasso一年多的时间里,她提到了90多个工作订单,加入了云厂商的飞行会员。

“云上的产品更新非常快,有时候会遇到各种运维问题,所以会要求下工单。”“帮手”离她有几千公里,但基本上几分钟就会有回复。“有时候技术问题比较难,技术支持人员会先回复我,然后具体解决。”。

一天早上,突然出现了技术问题,拉索的后台机器自动发出了警报。当时,刘林已经下班休息了。

30秒后问题就解决了。当林露看到第二天上班时的报警记录时,她发现阿里巴巴云的工单支持人员也在凌晨发消息解释问题原因。

“就像一个虚拟团队,它可以支持我,自己解决问题。”刘琳说。

Lasso使用的云计算产品和架构越来越多,对技术支持的需求也越来越频繁。沟通多了,大连的电话销售员小二林向义,杭州的服务人员小二徐群,甚至在北京林露上班休假的时候都牢记在心,组织产品经理和架构师前来拜访,为Lasso推荐基因计算的优化解决方案。

图|工作人员用移液器进行定量实验。

高密度基因芯片研发成功后,技术突破的故事还将继续。

罗帅种下的种子已经发芽了。借助人类基因图谱的密集体量,他正在为越来越多的人提供疾病风险预警,赶走面前的“怪物”。

罗帅快三十岁了,最怕父母身体出问题。我父亲是一个“不听劝告的顽固老头”。抽烟喝酒很常见。后来被罗帅拉去做基因检测。一旦检测结果显示患糖尿病的风险更高,他就“不固执”。他诚实地戒烟戒酒。每次罗帅回家都会被拉去打乒乓球。

看着父亲的背影,罗帅不禁感叹:“我们仰望星空空,不就是为了让身边的人过得更好吗?”



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